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Publications et Recherches appliquées

 

Année 2017

  • P. Calès, J. Boursier, F. Oberti, V. Moal, I. Fouchard-Hubert, S. Bertrais, G. Hunault, M. C. Rousselet and multicentric groups (SNIFF, ANRS HC 23).

    New blood test multi-targeted for liver fibrosis outperforms elastometry for most outcomes.
     
    AASLD (Poster, Octobre 2017).
  • J. Boursier, M. Barret, J. Macé, G. Hunault, C. Guy, L. Fizanne, A. Lannes, F. Oberti, I. Fouchard-Hubert, P. Calès, A. M. Diehl.

    La métagénomique montre des modifications dans la composition taxonomique et fonctionnelle du microbiote intestinal chez les patients atteints de NASH.
     
    AFEF (Communication orale, Octobre 2017).
  • Humeau-Heurtier A., Mahé G., Hunault G., Gascoin L., Abraham P.

    Multiscale Poincaré plot analysis of time series from laser speckle contrast imaging data.
     
    Biomedical Signal Processing and Control (July 2017).

Année 2016

  • E. Jaspard, G. Hunault

    sHSPdb: a database for the analysis of small Heat Shock Proteins.
     
    BMC Plant Biology (June 2016).
  • S. Rezki, C. Campion, B. Iacomi-Vasilescu, A. Preveaux, Y. Toualbia, S. Bonneau, M. Briand, E. Laurent, G. Hunault, P. Simoneau, M. A. Jacques, M. Barret.

    Differences in stability of seed-associated microbial assemblages in response to invasion by phytopathogenic microorganisms.
     
    PeerJ (March 2016).
  • Garbez M., Chéné Y., Belin E., Sigogne M., Labatte JM., Hunault G., Symoneaux R., Rousseau D., Galopin G.

    Predicting sensorial attribute scores of 1 ornamental plants assessed in 3D through rotation on video by image analysis: a study on the morphology of virtual rose bushes.
     
    Computers and Electronics in Agriculture Journal (January 2016).

Année 2015

  • Boursier J., Mueller O., Barret M., Machado M., Fizanne L., Araujo-Perez F., Guy C., Seed P., Rawls J., David L., Hunault G., Oberti F., Calès P., Diehl A.

    The severity of NAFLD is associated with gut dysbiosis and shift in the metabolic function of the gut microbiota.
     
    Hepatology (November 2015).
  • P. Cales, S. Bertrais, J. Boursier, F. Oberti, V. Moal, I. Fouchard Hubert, G. Hunault, M.C. Rousselet.

    Diagnostic and prognostic stagings are improved by multi-targeting biomarkers. Application to liver fibrosis tests.
     
    Journal of Hepatology (April 2015).
  • Rousseau C., Hunault G., Gaillard S., Bourbeillon J., Montiel G., Simier P., Campion C., Jacques M. A., Belin E., Boureau T.

    A web resource to dig into large Chlorophyll Fluorescence Image datasets.
     
    Plant Methods (April 2015).
  • Calès P. et al.

    Automated morphometry provides accurate and reproducible virtual staging of liver fibrosis in chronic hepatitis C.
     
    Journal of Pathology Informatics (January 2015).
  • Lerolle N., Macchi L., Carlier L., Hunault G.

    Ex vivo thrombin generation patterns in septic patients with and without disseminated intra vascular coagulation.
     
    Thrombosis Research (January 2015).
  • Barret M., Briand M., Bonneau S., Préveaux A., Valière S., Bouchez O., Hunault G., Simoneau P., Jacques M.A.

    Emergence shapes the structure of the seed-microbiota.
     
    Applied and Environmental Microbiology 2015. Vol 81.

Année 2014

  • Jaspard E., Hunault G.

    Comparison of amino acids physico-chemical properties and usage of Late Embryogenesis Abundant proteins.
     
    PLoS ONE (september 2014).
  • Jaspard E., Hunault G., Macherel D.

    Comparison of Late Embryogenesis Abundant proteins, WHy domain and Hydrophilins.
     
    New Frontiers in Anhydrobiosis Poster. PDF

    non su

  • P. Calès , J. Chaigneau , G. Hunault , S. Michalak , C. Cavaro-Menard , J.B. Fasquel , S. Bertrais , M.C. Rousselet.

    «Virtual Expert» staging by automated morphometry improves diagnosis and prognostic value of liver fibrosis.
     
    Journal of Hepatology (April 2014).
  • Calès P., Boursier J., Ducancelle A., Oberti F., Hubert I., Hunault G., de Lédinghen V., Zarski J.P., Salmon D., Lunel F.

    Improved fibrosis staging by elastometry and blood test in chronic hepatitis C.
     
    Liver Int. 2014.
  • Barrelle A., Hunault G.

    La létalité potentielle perçue par le patient des médicaments pris lors d'une intoxication médicamenteuse
    volontaire nous aide-t-elle à évaluer son désir de mourir ?
     
    Encéphale 2014, le congrès psychiatrique de la francophonie. Poster. PDF
  • Barrelle A., Hunault G.

    Auto-évaluation de la létalité potentielle perçue par le patient de son geste et décision
    d'hospitalisation dans les intoxications médicamenteuses volontaires
     
    Encéphale 2014, le congrès psychiatrique de la francophonie. Poster. PDF

Année 2013

  • C. Cavaro-Menard, P. Le Callet, G. Hunault, R. Pepion, M.-C. Rousselet

    Effect of JPEG2000 Compression on the Visual Quality of Virtual Liver Biopsy Slides: Subjective and Objective Measurements.
     
    Medical Image Perception Conference XV (MIPS XV), Aug 2013, Washington DC.
  • Macherel D., Jaspard E., Candat A., Hunault G., Poupart P., Rolland A., Benamar A., Avelange-Macherel M.H.

    Why so many LEA proteins ?
     
    Cryobiology and Cryotechnology. 2013 59 (1): 35-39.
  • Par et en collaboration avec P. Calès et J. Boursier.

    Dépôt du brevet européen Automatic measurement of lesions on medical images.
  • T. Boureau, M. Kerkoud, F. Chhel, G.Hunault, A. Darrasse, K. Durand, C. Brin, A. Hajri, S. Poussier, F. Saubion, M-A. Jacques.

    A multiplex-PCR assay for identification of the quarantine plant pathogen Xanthomonas axonopodispv. phaseoli.
     
    J. Microbiol Methods. 2013 Jan;92(1):42-50. doi: 10.1016/j.mimet.2012.10.012. Epub 2012 Nov 8.

Année 2012

  • Par et en collaboration avec P. Calès et J. Boursier.

    Dépôt du brevet européen Method for providing reliable non-invasive diagnostic tests.
  • Jaspard E., Macherel D., Hunault G.

    Computational and Statistical Analyses of Amino Acid Usage and Physico-Chemical Properties of the Twelve Late Embryogenesis Abundant Protein Classes.
     
    PLoS ONE 7(5): e36968. doi:10.1371/journal.pone.0036968
  • En collaboration avec T. Boureau, F. Chhel & al.

    Dépôt du brevet français «procédé de dépistage de Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli».
     
    INPI. publication 2970480
  • Traoré S., Boisdron-Celle M., Hunault G., André T. Morel A., Guerin-Meyer V., Capitain O., Gamelin E.

    DPD deficiency: Medicoeconomic evaluation of pretreatment screening of 5-FU toxicity.
     
    Gastrointestinal Cancers Symposium, San Francisco, Janvier 2012. Poster. PDF

Année 2011

  • Boursier J., Chaigneau J., Roullier V., Laine F., Sandrini J., Michalak S., Hubert I., Dib N., Oberti F., Bertrais S., Hunault G., Deugnier Y., Rousselet M. C., Cavaro-Ménard C., Gallois Y., Aubé C., Calès P. & the UNAM-METABOL study group.

    Steatosis degree, measured by morphometry, is linked to other liver lesions and metabolic syndrome components in patients with NAFLD.
     
    European Journal of Gastroenterology & Hepatology, Nov. 2011, 23 (11) ; 974-81.
  • Zhang L. Cavaro-Ménard C., Le Callet P., Cooper L.H.K., Hunault G., Tanguy J-Y.

    The effects of anatomical information and observer expertise on abnormality detection task.
     
    Poster. SPIE Medical Imaging, Orlando, Février 2011.
  • Fabien Chhel, Adrien Goeffon, Frédéric Lardeux, Frédéric Saubion, Gilles Hunault, Tristan Boureau

    Experimental Approach for Bacterial Strains Characterization
     
    EvoBIO'11, European Conference On Evolutionary Computation, Turin, Avril 2011.
    Short paper. SpringerLink.
  • Fabien Chhel, Adrien Goeffon, Frédéric Lardeux, Frédéric Saubion, Gilles Hunault, Tristan Boureau

    The Bacterial Strains Characterization Problem.
     
    Poster. SAC 2011, Symposium On Applied Computing, Taiwan, Mars 2011, LNCS.
    Proceedings of the 2011 ACM Symposium on Applied Computing.

Année 2010

  • P. Calès, J. Boursier, J. Chaigneau, V. Roullier, F. Lainé, J. Sandrini, S. Michalak,I. Hubert, N. Dib, F. Oberti, S. Bertrais, G. Hunault, M.C. Rousselet, C. Cavaro-Ménard, Y. Gallois, Y. Deugnier

    Poster. Non-invasive diagnosis of liver lesions by blood tests in NAFLD.
     
    Journal of Hepatology, Vol 52, S1.
  • Gilles Hunault and Emmanuel Jaspard

    LEAPdb: a database for the late embryogenesis abundant proteins.
     
    BMC Genomics 2010, 11:221.
  • Calès P., Boursier J., Chaigneau J., Lainé F., Sandrini J., Michalak S., Hubert I., Dib N., Oberti F., Bertrais S., Hunault G., Cavaro-Ménard C., Gallois Y., Deugnier Y., Rousselet M.C.

    Diagnosis of different liver fibrosis characteristics by blood tests in non-alcoholic fatty liver disease.
     
    Liver Int. PubMed PMID: 20666992.
  • Soutenance de la thèse de S. TRAORE

    Estimations non-paramétriques de coût médical et d'incidences d'événements cliniques : application à l'évaluation médico-économique d'un dépistage pré-thérapeutique des toxicités du 5-fluorouracile.
     
    Co-encadrement : E. Gamelin, G. Hunault. PDF.

Année 2009

  • A. Hajri, Brin C., Hunault G., Lemaire C., Manceau C., Boureau T., Poussier S.

    Evidences for selection on promoter region reveal a hidden aspect of the multifaceted evolution of the type three effector Avrbs2 in the Xanthomonas axonopodis species.
     
    International meeting on communication in plants and their responses to the environment, 7ème congrès de la Société Française de Phytopathologie, Jun 2009, Lyon, France. 2009
  • J. Boursier, J. Chaigneau, V. Roullier, L. Lainé, S. Michalak, I. Hubert, N. Dib, F. Oberti, G. Hunault, Y. Deugnier, M. C. Rousselet, C. Cavaro-Menard

    Histological and non-invasive quantitation of liver steatosis.
     
    Journal of Hepatology, Vol 50, S1.
  • Ahmed Hajri, Chrystelle Brin, Gilles Hunault, Frédéric Lardeux, Christophe Lemaire, Charles Manceau, Tristan Boureau, Stéphane Poussier.

    A « Repertoire for Repertoire » Hypothesis: Repertoires of Type Three Effectors are Candidate Determinants of Host Specificity in Xanthomonas.
     
    Plos One 4(8): e6632. doi:10.1371/journal.pone.0006632.
  • Organisation du deuxième séminaire sur la théorie des fractales et la recherche angevine.

    UFR Sciences, Angers, Juin 2009.
  • Traore S., Hunault G., Boisdron-Celle M., Gamelin E.

    Approche "multi-états" dynamique des coûts médicaux : application au dépistage pré-thérapeutique des toxicités du 5-FU proposé par le CPP.
     
    41èmes Journées de Statistique, SFdS, Bordeaux PDF.
  • Calès P., Lainé F., Boursier J., Deugnier Y., Moal V., Oberti F., Hunault G., Rousselet M., Hubert I., Laafi J., Ducluzeaux P., Lunel F.

    Comparison of blood tests for liver fibrosis specific or not to NAFLD.
     
    Journal of Hepatology 50, 2009.
  • J. Boursier, V. Roullier, J. Chaigneau, E. Cesbron-Metivier, F. Sandrini, F. Lainé, S. Michalak, I. Hubert-Fouchard, N. Dib, F. Oberti, G. Hunault, C. Aube, Y. Deugnier, M. Rousselet, C. Cavaro-Ménard, P. Cales.

    Quantification histologique et non-invasive de la stéatose hépatique.
     
    Poster. SNFGE/JFHOD.
  • Conception, réalisation de programmes de biostatistiques :

    Corrélations de Pagel et caractérisations spécifiques de groupes de bactéries phytopathogènes Xanthomonas.
     
    Programmes et Analyses réalisés dans le cadre du projet régional Xanthost I.N.R.A / Université d'Angers (« Paris scientifiques régionaux » 2008 de la Région Pays de la Loire).
  • Fontanier C., Goineau A., Jorissen F.J., Lansard B., Mouret A., Buscail R., Schmidt S., Kerhervé P., Buron F., Zaragosi S., Hunault G., Ernoult E., Artéro C., Anschutz P., C. Rabouille.

    The BEHEMOTH cruise : a multidisciplinary ecological investigation of live foraminiferal communities in the Gulf of Lions (NW Mediterranean).
     
    Poster. ASLO Aquatic Sciences Meeting, Nice.
  • Goineau A., Fontanier C., Jorissen F.J., Buscail R., Lansard B., Kerhervé P., Artéro C., Hunault G., Rabouille C., Ernoult E., E. Metzger.

    Decimetric scale spatial variability of live (stained) benthic foraminifera from the Rhône prodelta (Northwestern Mediterranean).
     
    Poster. ASLO Aquatic Sciences Meeting, Nice.

Année 2008

  • Paul Calès, Victor de Ledinghen, Philippe Halfon, Yannick Bacq, Vincent Leroy, Jérome Boursier, Juliette Foucher, Marc Bourlière, Anne de Muret, Nathalie Sturm, Gilles Hunault and Frédéric Oberti.

    Evaluating the accuracy and increasing the reliable diagnosis rate of blood tests for liver fibrosis in chronic hepatitis C.
     
    Liver international, free Online.
  • Calès P, Boursier J, Oberti F, Hubert I, Gallois Y, Rousselet MC, Dib N, Moal V, Macchi L, Chevailler A, Michalak S, Hunault G, Chaigneau J, Sawadogo A, Lunel F.

    FibroMeters: a family of blood tests for liver fibrosis.
     
    Gastroenterol Clin Biol. 2008 Sep;32(6 Suppl 1):40-51. .
  • C. Fontanie, F.J. Jorissen, B. Lansard, A. Mouret, R. Buscail, S. Schmidt, P. Kerhervé, F. Buron, S. Zaragosi, G. Hunault, E. Ernoult, C. Artero, P. Anschutz, and C. Rabouille.

    Live foraminifera from the open slope between Grand Rhône and Petit Rhône Canyons (Gulf of Lions, NW Mediterranean).
     
    Deep-Sea Research I, 2008.
  • Vincent Leroy, Philippe Halfon, Yannick Bacq, Jérôme Boursier, Marie-Christine Rousselet, Marc Bourliere, Anne de Muret, Nathalie Sturm, Gilles Hunault, Guillaume Penaranda, Marie-Claude Brechot, Candice Trocme, Paul Cales.

    Diagnostic accuracy, reproducibility and robustness of fibrosis blood tests in chronic hepatitis C: a meta-analysis with individual data.
     
    Clinical Biochemistry 41, June 2008.
  • Paul Calés, Pascal Veillon, Anselme Konaté, Elisabeth Mathieu, Catherine Ternisien, Alain Chevailler, Alban Godon, Yves Gallois, Françoise Joubaud, Isabelle Hubert-Fouchard, Frédéric Oberti, Stéphane Réud, Gilles Hunault, Françoise Mauriat, Françoise Lunel-Fabiani.

    Reproducibility of blood tests of liver fibrosis in clinical practice.
     
    Clinical Biochemistry.

Année 2007

  • P. Calès, P. Halfon, Y. Bacq, V. Leroy, M.C. Rousselet, M. Bourlièe, A. de Muret, N. Sturm, G. Hunault, G. Penaranda, M.C. Bréchot, C. Trocme, J. Boursier.

    Détermination des stades de fibrose, reproductibilité et robustesse des tests sanguins de fibrose dans l'hépatite chronique C.
     
    AFEF 2007. Communication. PDF.
  • S. Traoré, G. Hunault, M. Boidron-Celle, E. Gamelin

    Modèle de Markov et stratégies thérapeutiques.
     
    Journées des statisticiens des CRLCC, Angers, Mai 2007. PPT
     
    Arrivez-vous à me reconnaitre sur la photo ? shbg07.jpg

Année 2006

  • Implémentation des calculs de scores et d'aires de fibrose ; réalisation d'un "calculateur expert".

    Développement pour le CHU ; site BioLiveScale.

Année 2005

  • Création avec E. Jaspard et J. M. Richer d'une base de données pour l'étude de ponts disulfure ; réalisation d'un site Web et d'analyses statistiques associées à cette base de données.


    Site web : DBDB ; présentation générale l4a ; analyses statistiques : adbdb.php et anaje6.
  • E. Jaspard, G. Hunault et J. M. Richer.

    DBDB : a Disulfide Bridge DataBase for the predictive analysis of cysteine residues involved in disulfide bridges.
     
    JOBIM 2005. Poster. PDF
  • Poliakoff, F. ; Fischer-Le Saux, M. ; Hunault, G. ;
    François, C. ; Rivoal, C. ; Bonneau, S. ;
    Perret, S. ; Soubelet, H. ; Caffier, D.

    Computer-assisted identification and clustering for regulated phytopathogenic bacteria: construction of a reference database and development of a computer system.
     
    Bulletin OEPP/EPPO, Bulletin 35, 61-68. PDF

Années 2002-2004

  • Développement du logiciel CABIQ :

    Classification automatique et identification automatique de bactéries phytopathogènes de quarantaine.
     
    Logiciel développé dans le cadre du projet national conjoint I.N.R.A. / D.G.A. numéro 493. Développement effectué pour l'I.N.R.A. d'Angers et le L.N.P.V. d'Angers.

Années 1999-2001

  • Développement du logiciel TAXO :

    Classification automatique, validation de classes et taxonomie numérique de souches bactériennes.
     
    Développement effectué pour la station de Pathologie végétale de l'I.N.R.A. d'Angers.

Année 1998

  • Développement du logiciel ANALEXIES :

    Analyses lexicales simples : dictionnaires de formes graphiques et d'occurences, environnements de mots et codages pour la transcription d'enquêtes orales.
     
    Logiciel développé pour les T.D. de la Licence de Linguistique Appliquée à Paris III, Sorbonne Nouvelle.

Année 1997

  • E. Puerto, G. Hunault, D. Pacholczyk.

    Conceptual Negations of statements "x is A".
     
    Caepia'97, Proc. of VIIth Conf. Assoc. Espa. de Inteligencia Artificial.
  • L. Sutra, F. Siverio, M. M. Lopez, G. Hunault, C. Bollet, L.Gardan.

    Taxonomy of Pseudomonas strains isolated from tomato pith necrosis: emended description of Pseudomonas corrugata and proposal of three unnamed fluorescent Pseudomonas genomospecies.
     
    International Journal of Systematic Biology, 1997.
  • F. Beaujard, G Hunault.

    An original approach to study the kinetics of mineral element uptake for some woody species.
     
    Proc. Second Workshop, Env. Reg. of Plant Morphogenesis, Acta Hort. 435, ISHS 1997.

Année 1996

  • D. Pacholczyk, G. Hunault.

    Qualitative Reasoning under Uncertain Information with Symbolic Probabilities.
     
    KI'96 (poster)
  • D. Pacholczyk, G. Hunault.

    Application of a Symbolic Probability Theory to Qualitative Reasoning under Uncertain Information.
     
    IPMU'96 - Source Tex 33 k et son style 5 k ; en dvi 112 k ; en ps 65 k ; bibliographie 9 k.
  • D. Pacholczyk, G. Hunault, J. M. Pacholczyk.

    A Symbolic Probability Theory and its application to Qualitative Reasoning under the Uncertain Statements of the Natural Language.
     
    ISMIS'96 - Document Word 6 150 k.

Année 1995

  • D. Pacholczyk, J. M. Pacholczyk, G. Hunault.

    Explicit Management of the Natural Language Uncertainty via a Logico-symbolic Probability Theory.
     
    WOCFAI'95, p 295-306. 1995 - Document Word 2 de 78 k "zippé" 30 k.
  • L. Sutra, C. Juge, G. Hunault, L.Gardan.

    Phenotypic and biological characterization of fluorescent Pseudomonas isolated from the rhizosphere of banana plants.
     
    EEC-STD3 Workshop, Fort de France 1995.

Année 1994

  • G. Hunault, M. Thibeau, O. Villeret, J. Renard.

    l'Avenir du Qualiticien.
     
    Actes du Premier Congrès National sur la Qualité, Compiègne, Octobre 1994.
  • G. Hunault.

    Enquête sur une enquête.
     
    Actes de la Journée nationale du Déverminage des matériels électroniques Saclay , Décembre 1994.

Années 1993

  • Développement du logiciel TAXONUM :

    Classification automatique, validation de classes et taxonomie de souches bactériennes.
     
    Développement effectué pour la station de Pathologie Végétale et Phytobactériologie de l'I.N.R.A. d'Angers.

Années 1992

  • Développement du logiciel ANALEX :

    Analyses en statistique lexicale : construction de dictionnaires, recherche d'environnements, aménagement de textes pour la transcription d'enquêtes orales.
     
    Logiciel développé pour la Faculté des Lettres d'Angers.

Année 1991

  • G. Hunault, F. Beaujard, H. B. Luck, J. Luck.

    Infogenèse en biologie végétale. free preview (page 1)
     
    Séminaire de la Société Française de Biologie Végétale Solignac, Acta Biotheoretica 3, 253-270, 1991.
  • L. Gardan, S. Cottin, C. Bollet, G. Hunault.

    Phenotypic heterogeneity of Pseudomonas syringae.
     
    Van Hall. Res. Microbiol. I.P 142, 995-1003, 1991.

Année 1990

  • L. Gardan, S. Cottin, C. Bollet, G. Hunault, N. Boutefnouchet.

    Variabilité phénotypique de Pseudomonas syringae provenant de Laurier palme et d'hôtes variés.
     
    Agronomie 10, 407-416, 1990. PDF

Année 1989

  • Mise en place de procédures d'automatisation pour la classification automatique de souches bactériennes.

    Travail effectué en collaboration avec la station de Pathologie Végétale et Phytobactériologie de l'I.N.R.A. d'Angers.
  • Conversion de données de la Collection Française de Bactéries Phytopathogènes (CFBP) pour le BRG (Bureau des Ressources Génétiques) de Paris.

    Travail effectué suite à une demande de la station de Pathologie Végétale et Phytobactériologie de l'I.N.R.A. d'Angers.

Années 1985-1988

  • Participation au développement du logiciel SOLNUT :

    Définition de solutions nutritives et calcul d'équilibres ioniques.
     
    En collaboration avec F. BEAUJARD, Laboratoire d'Arboriculture de l'I.N.R.A. d'Angers dans le cadre d'un projet ANVAR.
  • Participation à la modélisation du développement et de la croissance des végétaux ligneux.

    Modélisation par systèmes L (LINDENMAYER), programmes d'inférence grammaticale et de visualisation d'arbres.
     
    En collaboration avec F. BEAUJARD, Laboratoire d'Arboriculture de l'I.N.R.A. d'Angers.

Année 1984

  • G. Hunault

    La lecture du journal : rubriques lues et signalement.
     
    Cahiers de l'Analyse des Données IX:3, 353-374, 1984

Année 1983

  • G. Hunault

    Classification hiérarchique de variables qualitatives.
     
    Thèse de 3ème cycle en Statistiques Mathématiques (Paris VI), spécialité Analyse des Données,
    sous la direction du professeur J. P. Benzécri. INIST

 

 

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