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Tuteur pour le logiciel R (ou "RSTAT")

Texte du Tuteur écrit par Gilles HUNAULT

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R est un logiciel de statistiques gratuit disponible pour Windows, Linux et MacIntosh. Il est interactif, programmable et facile à apprendre. Pour l'utiliser à la faculté des sciences d'Angers, consultez la note locale sur R.

Pour découvrir R, il est conseillé de récupérer le fichier PDF rstatdemo.pdf qui fait 10 Méga (à cause des images) ; ce fichier est compressé en rstatdemo.zip qui ne fait que 700k. Ce fichier d'une quinzaine de pages est une mini-présentation de R. Vous pouvez ensuite lire en ligne mon petit cours de R pour la Licence MFE (troisième année), mes exercices corrigés (en R) de statistiques pour la bioinformatique ainsi que mes exercices corrigés (via R) de biostatistiques. Si vous préferez une lecture plus traditionnelle, je vous conseille R pour sociologues pour comprendre comment utiliser R.

A titre d'exemple de fonctions en R, vous pouvez consuter le fichier statgh.r qui permet de simplifier l'écriture d'analyses statistiques en français avec R. Cela vous fournira aussi une idée de la qualité des possibilités graphiques de R.

anabiv lea stim1 stim1
s12metavir iris s12corr acp12
acp12ind bulkiGunip fig2 GLY

 

Pour approfondir vos connaissances en R, vous pouvez lire en français
les cours, TD et TP de pbil (Lyon), trés détaillés et très complets + des examens corrigés
Notes on R
qui est un manuel en ligne au format HTML)
Statistiques avec R (zoonek)
les cours du Ceremad (Licence Mass) (cliquer sur le lien "poly")
le poly de Christian Jost (pour les tests)
sachant que les deux sites officiels pour R sur lesquels vous pouvez télécharger gratuitement R sont le "CRAN" et le "R-project" à l'adresse
rlogo     http://cran.r-project.org
    http://www.r-project.org/
Vous pouvez utiliser R directement à partir d'internet via Rweb :
Rweb Lyon (conseillé, mais un peu lent)
Rweb Minnesota
Pour utiliser R, plutôt que l'interface standard, je vous conseille
    Rstudio
rlogo
    http://www.rstudio.org/

La documentation officielle pour le logiciel R est à l'adresse http://cran.r-project.org/manuals.html et les ouvrages écrits pour l'initiation et l'approfondissement de R sont à l'adresse http://cran.r-project.org/other-docs.html. Pour consulter ou effectuer une recherche pointue dans les documentations et "paquetages" de R, vous pouvez utiliser

Rdochtml : index des fonctions en ligne,
Rsitesearch : extension de recherche pour firefox,
search.r-project : site de documentation pour R.
Enfin, une jolie galerie des graphiques que permet R est à l'adresse
The R Graph Gallery

 

Une fois que vous connaitrez un peu R, il sera sans doute utile
d'avoir "sous le coude" l' Aide-memoire-R d'Aymeric DUCLERT (en français) et son équivalent anglais nommé Quick-R,
puis de lire le texte R pour Statophobes de Denis POINSOT
qui fait suite à Statistiques pour statophobes dont les copies locales
sont ici et . Le formulaire de statistiques, (en italien), utile pour voir des calculs classiques en R, est ici
avec une copie locale . Enfin, lisez notre pot-pourri d'expressions R qui vous apprendra
peut-être quelques "trucs"...

Signalons aussi deux ouvrages d'initiation à R en français :

 

cornillon

 

 

bertrand

 

Enfin, pour bien maitriser R et en avoir une vue un peu plus complète sur le logiciel R et ses packages, je ne saurais trop vous conseiller la lecture de l'ouvrage R in a nutshell de J. Adler, mais si vous êtes plus à l'aise avec le français que l'anglais, lisez R l'essentiel qui vient de paraitre (novembre 2011) aux éditions Pearson et qui en est la traduction, à laquelle j'ai contribué. Regardez aussi l'auteur de la préface, vous devriez le reconnaitre !

 

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