Analyse de la dbdb, le 11 / 02 / 2005 vers 16 h 35 :

PROTEINS
 total    248  
 with both 11  
 without 56  
 total chains 284  
BRIDGES
 total    557  
 intra 527  
 inter 30  
 
CYSTEINS
 total    ???  
 intra 1054  
 inter 60  
 free ???  

  Quelques comptages simples

Nombre de protéines (champ pr_id) :    248
Protéines avec ponts inter et intra : 11
Protéines sans ponts : 56
Nombre de chaines en tout : 284
Nombre de ponts en tout : 557
Nombre de ponts inter : 30
Nombre de ponts intra : 527

  Analyse plus fine

Liste des 11 protéines avec ponts inter et intra
num pr_id PDB_id désignation bricolage Genre espèce
1 2   1HUC   Cathepsin B ??? Homo sapiens
2 9   1APH   Insulin ??? Bos taurus
3 19   1M5A   Insulin ??? Sus scrofa
4 32   1F0S   Coagulation factor xa ??? Homo sapiens
5 36   1JVO   Azurin ??? Pseudomonas aeruginosa
6 132   1ABR   Abrin a ??? Abrus precatorius
7 153   2BI6   Bromelain inhibitor vi ??? Ananas comosus
8 169   1BM3   Complex immunoglobulin opg2 fab - peptide ??? Mus musculus
9 170   1CIC   Complex idiotope - anti-idiotope fab - fab (d1.3 - e225) ??? Mus musculus
10 220   1AGQ   Glial cell-derived neurotrophic factor ??? Rattus norvegicus
11 232   4RUB   Ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase oxygenase ??? Nicotiana tabacum
Liste des 56 protéines sans ponts
num pr_id PDB_id désignation bricolage Genre espèce
1 16   1AUP   Nad-Specific Glutamate DehydrogenaseOxidoreductase ??? Clostridium symbiosum
2 17   1BVU   Glutamate Dehydrogenase (NAD(P)+) ??? Thermococcus litoralis
3 65   1A5Y   Protein tyrosine phosphatase 1B ??? Homo sapiens
4 71   1BR2   Smooth muscle myosin motor domain ??? Gallus gallus
5 72   1BG2   Kinesin motor domain ??? Homo sapiens
6 73   1FHG   Telokin ??? Meleagris gallopavo
7 74   1JX2   Myosin ii heavy chain ??? Dictyostelium discoideum
8 75   1AUI   Serine/threonine phosphatase 2b (calcineurin) ??? Homo sapiens
9 76   1ALV   Calpain ??? Sus scrofa
10 77   1HKX   Calcium/calmodulin-dependent protein kinase ??? Mus musculus
11 78   1GG3   Erythroid membrane protein 4.1r ??? Homo sapiens
12 79   3PFK   Phosphofructokinase ??? Bacillus stearothermophilus
13 81   1HHB   Hemoglobin (deoxy) ??? Homo sapiens
14 82   4HHB   Hemoglobin (deoxy) ??? Homo sapiens
15 83   2FOX   Flavodoxin ??? Clostridium beijerinckii
16 84   1FD1   Ferredoxin ??? Azotobacter vinelandii
17 86   451C   Cytochrome c551 ??? Pseudomonas aeruginosa
18 88   3LZM   Lysozyme ??? Coliphage t4
19 89   1G6N   Catabolite gene activator protein ??? Escherichia coli
20 90   1FXC   Ferredoxin ??? Spirulina platensis
21 91   3CLA   Type iii chloramphenicol acetyltransferase ??? Escherichia coli
22 92   1CYO   Cytochrome b5 ??? Bos taurus
23 93   1ADK   Adenylate kinase ??? Sus scrofa
24 95   2TS1   Tyrosyl-transfer rna synthetase ??? Bacillus stearothermophilus
25 96   2STV   Satellite tobacco necrosis virus ??? Tobacco necrosis virus
26 100   1IQZ   Ferredoxin ??? Bacillus thermoproteolyticus
27 101   1CPP   Cytochrome p450 (camphor monooxygenase) ??? Pseudomonas putida
28 102   1CDV   Cytochrome c3 ??? Desulfovibrio vulgaris
29 106   1EB7   Cytochrome c551 peroxidase ??? Pseudomonas aeruginosa
30 107   1GQ2   Malate dehydrogenase ??? Columba livia
31 108   1GYN   Fructose-bisphosphate aldolase ii ??? Escherichia coli
32 109   1GZ3   Malate dehydrogenase ??? Homo sapiens
33 111   1W23   Phosphoserine aminotransferase ??? Bacillus alcalophilus
34 113   1BKS   Tryptophan synthase ??? Salmonella typhimurium
35 116   1RNH   Ribonuclease h ??? Escherichia coli
36 117   1RHD   Rhodanese ??? Bos taurus
37 119   1PRC   Photosynthetic reaction centre ??? Blastochloris viridis
38 120   1PHH   Hydroxybenzoate hydroxylase ??? Pseudomonas fluorescens
39 122   1HIP   High potential iron protein ??? Chromatium vinosum
40 123   1GP1   Glutathione peroxidase ??? Bos taurus
41 124   4GCR   Eye lens protein crystallin ??? Bos taurus
42 125   1FNB   Ferredoxin reductase ??? Spinacia oleracea
43 127   1BBP   Bilin binding protein ??? Pieris brassicae
44 130   155C   Cytochrome c550 ??? Paracoccus denitrificans
45 157   1AH5   Hydroxymethylbilane synthase (porphobilinogen deaminase) ??? Escherichia coli
46 175   1BX6   Camp-dependent protein kinase ??? Mus musculus
47 176   1DOX   Ferredoxin ??? Synechocystis pcc6803
48 189   1GL3   Aspartate semialdehyde dehydrogenase ??? Escherichia coli
49 210   1A23   Dsba ??? Escherichia coli
50 215   1AK5   Inosine monophosphate dehydrogenase ??? Tritrichomonas foetus
51 230   2RUB   Ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase oxygenase ??? Rhodospirillum rubrum
52 231   8RUB   Ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase oxygenase ??? Spinacia oleracea
53 233   1CAC   Carbonic anhydrase ii (carbonate dehydratase) ??? Homo sapiens
54 234   5ACN   Aconitase hydratase ??? Sus scrofa
55 235   8ACN   Aconitase hydratase ??? Bos taurus
56 236   1YAS   Hydroxynitrile lyase (gluconate dehydratase) ??? Hevea brasiliensis
-- fin d'analyse de la dbdb, le 11 / 02 / 2005 vers 16 h 43 :
 

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