Ancien élève de l'Université d'Angers, Maitre de conférences en 26ème section (Mathématiques Appliquées et Applications des Mathématiques)

Je déplore le manque de culture, d'intelligence et de chaleur personnelle dans les rapports humains en particulier pour tous les gens qui ont beaucoup de diplomes et pas beaucoup de coeur.

 

ACTIVITES ET TRAVAUX

 

Enseignement

Statistiques, Logiciels Statistiques et Initiation à Sas (sas tutorial)    Langages de scripts et développement Web (Master)    Développement Web Avancé : Php et MySQL (Licence, année L2)    Développement Web (Licence Pro) et Technologie XML (Master)    Informatique pour le Web en licence DSCS (Diffuson du Savoir)    Fichiers de données réelles pour études statistiques      Algorithmique, Langages et Styles de Programmation    Statistiques, Probabilités & Statistiques et Analyse des Données    Remise à niveau en Mathématiques pour la Licence Informatique    Tuteurs (dont perl tutorial, xml tutorial, ajax tutorial)    Quelques examens des années précédentes    Projets de programmation

des cours agréables à regarder,  j'espère.

quelques conseils pour réussir ses études jusqu'à la thèse

Recherche fondamentale et appliquée

Chercheur au laboratoire HIFIH, UPRES EA 3859, SFR 4208 (Hémodynamique, Interaction, Fibrose,
Invasivité tumorale Hépatique et Digestive) depuis 2006.

Diagnostic, aires et scores de Fibrose (CHU) sous la direction de Paul CALES.     Découverte de motifs souples et spécifiques d'acides aminés au sein de classes de protéines      en collaboration avec D. LESAINT et E. JASPARD dans le cadre d'un projet interne de l'université d'Angers (2013).     Aide à la caractérisation spécifique minimale de pathovars de Xanthomonas par des répertoires d'effecteurs (INRA/LERIA)      en collaboration avec T. BOURREAU et F. LARDEUX, F. SAUBION... Résultats.     Aide à la classification des protéines LEA, base de données : LEAPDB      (LEAP Database, Late Embryogenesis Abundant Protein Database)      en collaboration avec E. JASPARD ; analyse de protéines sHSP, base de données : SHSPDB.      Analyse mathématique et médico-économique du dépistage pré-thérapeutique des toxicités      liées au 5-FU dans le cancer colo-rectal via une modélisation "multi-états",      en collaboration avec S. TRAORE et E. GAMELIN, M. BOISDRON-CELLE (Centre Paul Papin, INSERM U892, Angers).     Aide à la prédiction de ponts disulfure par des alphabets multiples, base de données : DBDB      (Disulfide Bridge DataBase).      Classification et Identification de bactéries phytopathogènes (INRA/LNPV).      "Remontée" mathématique à la grammaire pour une suite de mots, une suite de longueurs de mots...      (Recovering minimal L systems from words and lengths sequences).     Arbres (topologiques, botaniques...) et langages formels ("systèmes L" [Lindenmayer]")      pour plus de détails, voir mes publications et travaux de reherche.      une liste de sites et moteurs pour la recherche d'articles.

un travail de longue haleine

Réalisation d'outils logiciels et d'aides en Mathématiques/[bio]Informatique/Statistiques

AnalexieS : analyses lexicales simples   Cabiq : classification et identification de bactéries   PhyNp : Arbres phylogénétiques et problèmes NP-complets    calcstat : calculs statistiques en ligne    Scripts cgi et programmes pour le Web dont jphistopct (histogrammes de pourcentages interactifs)    galg, un analyseur, traducteur et exécuteur d'algorithmes    gnumdata, "a program for mastering data files"    Tuteurs et petits manuels    Programmes de statistiques et Analyse des Données    Développement de programmes en Awk, Rexx, Perl, et Maple    Développement de scripts et utilitaires multi-plateformes (Windows et Unix)    dont listgh, un visualiseur rapide de fichiers (écrit en en Tcl/Tk)    Vitrine de démonstration de programmes   Quelques sites de référence

quelques (humbles) contributions...

Recherche en Intelligence Artificielle au LERIA jusqu'en décembre 1997

Raisonnement qualitatif et typique
Négation et Ressemblance
Logique M-valuée et multi-ensembles
Théorie symbolique des probabilités
 
   voir les publications et articles associés.

 

Derniers ajouts marquants

	Juin	2013	:	Dépôt du brevet européen Automatic measurement of lesions on medical images,
				par et en collaboration avec P. Calès et J. Chaigneau.
	Mai	2013	:	Un formulaire pour réaliser des calculs et des comptages sur des séquences Fasta.
	Avril	2013	:	Tournée annuelle de Vox Campus en Allemagne, plannings prévisionnels et récit des journées.
	Janvier	2013	:	Une page pour expliquer ce qu'est le PHP conceptuel ou FTM (Function Tag Mapping).
	Décembre	2012	:	Un tuteur pour le langage Ruby (version 1.9.1).
	Novembre	2012	:	Un tuteur pour le langage Python (version 3.1).
	Octobre	2012	:	Une interface pour le solveur mcps de charactérisation multiple spécifique minimal développé par F. Chhel
				en collaboration avec T. Bourreau, F. Lardeux et F. Saubion (voir aussi des exemples de résultats).
	Juillet	2012	:	Dépôt du brevet français «procédé de dépistage de Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli»,
				publication 2970480, en collaboration avec T. Boureau, F. Chhel & al.
	Juillet	2012	:	Dépôt du brevet européen Method for providing reliable non invasive diagnostic tests,
				par et en collaboration avec P. Calès et J. Boursier.
	Juin	2012	:	Mise à disposition d'une base de données pour des protéines sHSP (small Heat Shock Proteins) : SHSPDB,
				en collaboration avec E. Jaspard.
	Mai	2012	:	MOCAR, une interface pour détecter des motifs communs et/ou spécifiques d'acides aminés dans des groupes de séquences Fasta.
				à partir d'un programme C écrit par P. Gallinier (Ecole Polytechnique de Montréal).
	Avril	2012	:	Journée d'étude Mise en discours des sciences et des technologies
				organisée par Sémiologie actuelle et Les Petits Débrouillards avec le concours de la FLASH de l'université de La Rochelle ;
				le programme des journées est à télécharger sur le site de Laurence BRUNET.
				Conférence (gH) : Faut-il se fier aux modèles de réchauffement climatiques ?
	Avril	2012	:	Cours/conférence pour lycéens et lycéennes :
				Comment les statistiques aident les médecins à guérir les malades.
	Mars	2012	:	Programmation R approfondie, formation pour l'INRA (avec exercices corrigés).
				Au programme : éviter les programmes naifs, debuger, optimiser...
	Février	2012	:	Tournée annuelle de Vox Campus en Angleterre, plannings prévisionnels et récit des journées.
	Janvier	2012	:	RMFE, cours d'introduction au logiciel R en L3 Mathématiques Finance Economie.
	Nov.	2011	:	Contribution technique et écriture de la préface à la traduction de R in a nutshell de J. Adler,
				qui vient de paraitre sous le titre R l'essentiel aux éditions Pearson.
	Juin	2011	:	Stim, 4 h d'exposé pour l'Ecole doctorale STIM : XML et bioinformatique
	Juin	2011	:	Réunion du GREBA : taille de fenêtre d'analyse et bioikseml
	Juin	2011	:	Journée d'hommage à Anne-Marie Houdebine (à La Rochelle) : programme de la journée (PDF).
				Les communications sont disponibles sur le site de Laurence BRUNET.
	Mars	2011	:	Développement Web en L2 (licence de Sciences, deuxième année) :
				des cours, des td corrigés et des tp également. On y parle de XHTML et de Javascript principalement et un peu de XML.
	Juin	2010	:	Stim, 6 h d'exposé pour l'Ecole doctorale STIM : entrées, sorties, XML et statistiques
	Mai	2010	:	Une fonction générique pour diaporamas de sites Web : démonstrations
	Fév.	2010	:	Une interface pour les fonctions de statgh.r et une interface pour les fonctions de std.php.
	Déc.	2009	:	Un tuteur AJAX (AJAX tutorial) : traitement asynchrone de XML en Javascript.
	Sept.	2009	:	Contribution technique à l'ouvrage Manuel de prise en main de XML aux éditions Pearson, collection Le Programmeur ;
				vous pouvez en consulter la table des matières.
	Août	2009	:	vdt : Vitesse De Transmission et tep : Taille en Pouces, deux formulaires bien utiles !
	Juin	2009	:	La théorie des fractales et la recherche angevine : organisation du deuxième séminaire par votre serviteur.
	Juin	2009	:	ASPW, Analyse syntaxique de pages web (projet informatique) :    sujet    réalisation
	Mai	2009	:	Traduction de l'ouvrage Biostatistique pour les sciences de la vie et de la santé de Marc TRIOLA et Mario TRIOLA
				pour les éditions Pearson France :    version française    version anglaise.
	Avril	2009	:	5 séances de BioStatistiques pour l'école doctorale Biologie Santé,
				soit une cinquantaine d'exercices détaillés et corrigés : EDA Biostat.
	Avril	2009	:	Essais de définitions d'un indice de fiabilité (dispersion relative invariante par translation),
				le mieux est sans doute de diviser l'écart-type des données par l'écart-type maximal sous-jacent : indvarif.
	Mai	2008	:	Calculs de CCD (Coefficients de Capacité Diagnostique) : exemples en ligne.
	Mars	2008	:	Quantiles et Boites à Moustaches, projet de programmation "LicPro" : sujet (gH), réalisation (étudiants).
	Nov.	2007	:	Un "pot-pourri" d'expressions pour le logiciel R et pour Sas.
	Oct.	2007	:	Une page Web sur les tests d'hypothèses statistiques
				avec une liste des tests disponibles dans le logiciel R.
	Oct.	2007	:	OSEP : implémentation d'Objets Statistiques En Php
	Sept.	2007	:	Tracé de courbe ROC et autres courbes pour tests diagnostiques,
				calcul d'AUROC et de seuils ("cutoffs") de maximisation.
	Mai	2007	:	Partie Statistiques du cours d'initiation à la Bioinformatique (L3).
	Avril	2007	:	mcg = Surveillance de mots-clé via Google
	Janv.	2007	:	GREADIS = Groupe de Recherche et d'Etude en Analyse du Discours en Ingénierie et en Science.
	Mai	2006	:	Richmedia et smil, les cours des autres en vidéo sur le Web.
	Avril	2006	:	Analyse générale et fine de la DBDB
				- analyse des 6 jeux d'essais de la DBDB     - "quizz" sur les acides aminés (projet étudiant).

Dernières mises à jour et compléments

	Octobre	2012	:	Mise à jour de la page principale du GA&P (Groupe Analyses et Procédés)
	Sept.	2012	:	Remise à niveau pour le cours de développement Web en Licence Profesionnelle.
	Juillet	2012	:	Calculs de tailles d'échantillon pour estimer une proportion, une moyenne, un coefficient de corrélation classique ou intraclasse : taillechant.
	Juillet	2012	:	Calculs d'intervalles de confiance pour une proportion, une moyenne, un écart-type avec rappel des formules programmées : estimation.
	Janv.	2011	:	Reprise du tuteur PERL.
	Nov.	2010	:	Hilapr = [petite] Histoire des langages de Programmation.
	Nov.	2010	:	Sac = Stockage, Archivage et Compression (cours M2 Mia puis M2 Cdsii).
	Mars.	2010	:	Partie Statistiques du cours de BioInformatique, Master BTV : bism.
	Juin	2009	:	Nouvelles fonctionnalités pour LEAPDB, notre base de données des protéines LEA.
	Mai	2009	:	Consolidation de statgh.r, statistiques descriptives à la française avec le logiciel R.
	Avril	2009	:	Reprise du tuteur MYSQL avec des exercices corrigés progressifs sur 2, 3 et 4 tables
				dans une même base de données.
	Sept.	2008	:	Reprise du tuteur JavaScript avec des exemples de gestion dynamique d'une page Web via DOM
				(Modèle de l'Objet Document).
	Févr.	2008	:	Repères statistiques pour doctorants : polycopié de cours et références Web.
	Nov.	2007	:	CalcDist, projet de programmation M2CCI (calcul de distances).
	Fév.	2007	:	Améliorations du tuteur XML et consor : DTD, XSD (Schémas) et autres XSLT (transformations).
				avec une mention spéciale pour SVG.
	Janv.	2007	:	Consolidation de pw, sensibilisation aux pages web et panorama de la "technologie Internet"
				dont le texte "critiquer" les pages Web.

 

  Loisirs

Jeux d'échecs, hockey sur gazon, badminton
Lecture, Cinéma (notamment "SF" et "Polars")

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Au Travail : Faculté des Sciences, Boulevard Lavoisier, Batiment H bureau H103
02 41 73 54 64 et Fax 02 41 73 54 54

A la maison : 65 rue Desjardins (49100 - Angers) 09 54 29 68 10
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Contraintes horaires prévues pour ce mois : horergh.pdf.

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