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Caractérisation spécifique de groupes version 1.07

Table des matières cliquable

1. Caractérisations pour le dossier ra_rep1

2. Liste des colonnes de caractérisation pour ra_rep1

3. Classification restreinte aux colonnes de caractérisation pour ra_rep1

1. Caractérisations pour le dossier ra_rep1

Caractérisation du groupe 1 soit II.1

Aucune caractérisation du groupe n'est vue dans le fichier résultat du solveur.

Caractérisation du groupe 2 soit II.2

Aucune caractérisation du groupe n'est vue dans le fichier résultat du solveur.

Caractérisation du groupe 3 soit II.3

Une caractérisation du groupe est donnée par la formule : ~146 ET ~76 ET (~61|108) ET (74|145).

Ce qui correspond aux données :

     Galactose = 0 et DL-Lactate = 0 et (D-Gluconate = 0 ou Urease = 1) et (DL-alpha-Amino-n-Butyrate_(=_4-Aminobutyrate) = 1 ou Nitrite_Reductase = 1)

Caractérisation du groupe 4 soit II.4

Une caractérisation du groupe est donnée par la formule : ~146 ET ~132 ET 51 ET (~108|~44) ET (~2|76).

Ce qui correspond aux données :

     Galactose = 0 et Maltose = 0 et cis-Aconitate = 1 et (Urease = 0 ou D-Saccharate = 0) et (beta-D(+)_Fructose = 0 ou DL-Lactate = 1)

Caractérisation du groupe 5 soit II.5

Une caractérisation du groupe est donnée par la formule : ~54 ET 63.

Ce qui correspond aux données :

     Citrate = 0 et Protocatechuate = 1

Caractérisation du groupe 6 soit IetIII

Une caractérisation du groupe est donnée par la formule : (~52|34) ET (~45|30|63) ET (~126|~45|30|64).

Ce qui correspond aux données :

     (trans-Aconitate = 0 ou D-Mannitol = 1) et (Mucate = 0 ou Dulcitol = 1 ou Protocatechuate = 1) et (Tween80 = 0 ou Mucate = 0 ou Dulcitol = 1 ou p-Hydroxybenzoate_(=_4-Hydroxybenzoate) = 1)

Caractérisation du groupe 7 soit IV

Une caractérisation du groupe est donnée par la formule : ~20 ET 99 ET (52|~81).

Ce qui correspond aux données :

     D(-)_Ribose = 0 et alpha-Ketoglutarate_(=_2-Ketoglutarate,_2-Oxoglutarate) = 1 et (trans-Aconitate = 1 ou Fumarate = 0)

Il s'agit donc d'une caractérisation partielle seulement.

2. Liste des colonnes de caractérisation pour ra_rep1

Liste par numéro de groupe pour ra_rep1

Numéro Groupe Colonnes
1      II.1
2      II.2
3      II.3 146-   76-   61-   108+   74+   145+  
4      II.4 146-   132-   51+   108-   44-   2-   76+  
5      II.5 54-   63+  
6      IetIII 52-   34+   45-   30+   63+   126-   64+  
7      IV 20-   99+   52+   81-  

Liste par numéro de colonne pour ra_rep1

Indice Numéro Nom Groupe(s)
1    2    beta-D(+)_Fructose   4-  
2    20    D(-)_Ribose   7-  
3    30    Dulcitol   6+  
4    34    D-Mannitol   6+  
5    44    D-Saccharate   4-  
6    45    Mucate   6-  
7    51    cis-Aconitate   4+  
8    52    trans-Aconitate   6-   7+  
9    54    Citrate   5-  
10    61    D-Gluconate   3-  
11    63    Protocatechuate   5+   6+  
12    64    p-Hydroxybenzoate_(=_4-Hydroxybenzoate)   6+  
13    74    DL-alpha-Amino-n-Butyrate_(=_4-Aminobutyrate)   3+  
14    76    DL-Lactate   3-   4+  
15    81    Fumarate   7-  
16    99    alpha-Ketoglutarate_(=_2-Ketoglutarate,_2-Oxoglutarate)   7+  
17    108    Urease   3+   4-  
18    126    Tween80   6-  
19    132    Maltose   4-  
20    145    Nitrite_Reductase   3+  
21    146    Galactose   3-   4-  

Matrice de présence/absence des souches, restreinte aux seules 21 colonnes impliquées

Format : Souche Groupe Caractères

3. Classification restreinte aux 21 colonnes de caractérisation pour ra_rep1

Avec une caractérisation partielle, il n'est pas possible de tracer une classification.

 

          liste des analyses effectuées          vérification des solutions

 

          Code-source de la page

 

 

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