 | Recherche Publications |
 |
 |
 |
 |
 |
 |
 |
Publications
- 2009
Jean-Michel Richer, Adrien Goëffon, Jin-Kao Hao, A Memetic Algorithm for Phylogenetic Reconstruction with Maximum Parsimony, Proceedings of EvoBIO 2009, Tübingen, Germany, April 2009 (article, lecture)
- 2008
Jean-Michel Richer, Three new techniques to improve phylogenetic reconstruction with Maximum Parsimony, Technical Report, LERIA, 2008 (PDF).
- 2007
Jean-Michel Richer, Vincent Derrien, Jin-Kao Hao, A New Dynamic Programming Algorithm for Multiple Sequence Alignment, (COCOA 07), Xi'an, Shaanxi, China, 12-15 August 2007. LNCS 4616, ISBN 978-3-540-73555-7. lecture, article (32 papiers acceptés parmi 114, soit 28 %) Adrien Goeffon, Jean-Michel Richer, Jin-Kao Hao, Progressive Tree Neighborhood applied to the Maximum Parsimony Problem, In IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics (TCBB), 2007 (PDF).
- 2006
Adrien Goeffon, Jean-Michel Richer, Jin-Kao Hao, A Distance-based Information Preservation Tree Crossover for the Maximum Parsimony Problem, In Proceedings of Parallel Problem Solving From Nature IX, (PPSN 06), Reykjavik, September 2006 (PDF). Adrien Goeffon, Jean-Michel Richer, Jin-Kao Hao, Hybrid Evolutionary Algorithm for reconstructing Phylogenetic Trees, Actes des Septièmes Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques (JOBIM'06), Bordeaux, France, Juillet 2006.
- 2005
Adrien Goeffon, Jean-Michel Richer, Jin-Kao Hao, Recherche locale à voisinage évolutif pour la reconstruction de phylogénies, Actes du 6ème Congrès National sur la Recherche Opérationnelle et l'Aide à la Décision (ROADEF'05), pp 187-188, Tours, Février 2005. Adrien Goeffon, Jean-Michel Richer, Jin-Kao Hao, Local Search for the Maximum Parsimony Problem, 2005 International Conference on Natural Computation (ICNC'05), Changsha, Chine, 27-29 August 2005, Lecture Notes in Computer Science 3612: 678-683, Springer-Verlag 2005. (PDF) Adrien Goeffon, Jean-Michel Richer, Jin-Kao Hao, Voisinage d'arbre évolutif appliqué au problème de Maximum Parcimonie, Actes des Premières Journées Francophones de Programmation par Contraintes (JFPC'05), Lens, Juin 2005. Vincent Derrien, Jean-Michel Richer, Jin-Kao Hao, PLaSMA : un nouvel algorithme progressif pour l'alignement multiple de séquences, Actes des Premières Journées Francophones de Programmation par Contraintes (JFPC'05), Lens, Juin 2005. Adrien Goeffon, Jean-Michel Richer, Jin-Kao Hao, Voisinage d'arbre évolutif appliqué au problème de Maximum Parcimonie, Actes des Sixièmes Journées Ouvertes en Biologie Informatique et Mathématiques (JOBIM'05), Lyon, France, Juillet 2005. PDF Adrien Goeffon, Jean-Michel Richer, Jin-Kao Hao, Progressive Tree Neighborhood Applied to the Maximum Parsimony Problem, Mini EURO Conference on Variable Neighborhood Search (MECVNS 05), Tenerife, Espagne, Novembre 2005.
- 2003
Vincent Derrien, Jean-Michel Richer, Jin-Kao Hao, PLaSMA : une approche hybride pour l'alignement multiple de séquences, 5ème Congrès de la Société Française de Recherche Opérationnelle et d'Aide à la Décision (ROADEF'03), pp 77-78, Avignon, 26-28 Février 2003.
- 2002
Vincent Derrien, Jean-Michel Richer, Jin-Kao Hao, A new hybrid approach to Multiple Sequence Alignment, 7th International Conference on Parallel Problem Solving From Nature (PPSN 2002), Workshop on Bioinformatics, pp 31-32, Granada, Spain, September 2002.
- 1999
Jean-Michel Richer, Jean-Jacques Chabrier, Sacre: A Constraint Satisfaction Problem Based Theorem Prover, In Proceedings of the Sixteenth National Conference on Artificial Intelligence (AAAI-99), Orlando, Florida, July 18-22, 1999. aaai99.ps, aaai99.pdf
- 1997
Jean-Michel Richer, Jean-Jacques Chabrier, Une approche de résolution de problèmes en logique basée sur des techniques de satisfaction de contraintes, Sixièmes Journées Francophones de Programmation Logique et Programmation par Contraintes (JFPLC'97), Orléans, France, 26-28 mai 1997.
- 1996
Jacqueline Chabrier, Jean-Michel Richer, Jean-Jacques Chabrier, Resolution of Structured SAT problems with Score(FD/B), Second International Conference on Principles and Practice of Constraint Programming (CP'96), Cambridge, Massachusetts, USA, August 19-22, 1996. Lecture Notes in Computer Science No. 1118. cp96.ps, cp96.pdf