Le Master est un diplôme de niveau Bac + 5 (M). Il est composé de 2 années différentes (M1 à Bac + 4 et M2 à Bac + 5). L'objectif du Master informatique est de fournir une formation polyvalente en informatique & de préparer l’insertion professionnelle des étudiants, pour la majorité en entreprise mais également dans des laboratoires de recherche publics ou dans des départements de recherche et développement industriels. On distingue ainsi un Master professionnel (M2P) dont le but principal est de préparer à un emploi d'un Master recherche (M2R) qui permet notamment de poursuivre en Doctorat (D).

Le département informatique propose une unique première année de Master (M1), dite Maîtrise d'informatique. Son accès est de plein droit pour les titulaires d'une Licence informatique (L3). L'essentiel de l'enseignement a lieu en informatique ; un stage de 10 à 12 semaines fait partie de la formation.

Le département informatique propose trois deuxièmes années différentes de Master (M2), chacune ayant un programme spécifique.

Les deux Masters professionnels proposés (M2P) sont composés d'une partie académique enseignée par des universitaires et des professionnels. Les enseignements ont lieu principalement en informatique mais aussi dans des matières utiles en entreprise (communication, langues...). L'autre partie de la formation consiste en la réalisation de projets et un stage de 5 mois minimum en entreprise. L'insertion professionnelle dans les métiers de l'informatique (chef de projet, administrateur BD ou réseau, programmeur, ingénieur système...) est la priorité de ces formations. Le M2P Conception et développement de solutions informatiques intégrées (anciennement Méthodes Informatiques Avancées, MIA) s'adresse à des étudiants d'un bon niveau en informatique ayant typiquement un M1 en informatique ou MASS, une MST, un diplôme d'IUP. Le M2P Compétences Complémentaires en Informatique (CCI) s'adresse à des étudiants sans grande connaissance de l'informatique ayant par exemple une maîtrise de math, de physique, de biologie, un diplôme d'ingénieur agronome...

Le M2R Calcul Interaction Décision (CID) est composé d'une partie académique et d'un stage en laboratoire de recherche (LERIA-EA, ...). Ce Master s'adresse à des étudiants Bac + 4 d'un bon niveau en informatique ayant typiquement un M1 informatique ou au moins 4 années validées en école d'ingénieur. Une partie des diplômés poursuit en doctorat et une autre dans les métiers de l'informatique (chef de projet, ingénieur de recherche...).